Spór w sprawie dotyczył tzw. ulgi na złe długi po zmianie przepisów od 1 stycznia 2013 r.
Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością została postawiona w stan upadłości likwidacyjnej. Aktualnie zarządza nią syndyk masy upadłości, który m.in. składa bieżące deklaracje podatkowe, gdyż przedsiębiorca nadal jest czynnym podatnikiem VAT. Syndyk zapytał czy działając w imieniu własnym, lecz na rzecz upadłego, jest zobowiązany do korekty podatku naliczonego w trybie art. 89b ust. 1 ustawy o VAT. Sam uważał, że nie.
Innego zdania był fiskus. Wyjaśnił, że syndyk w prowadzonym postępowaniu upadłościowym, składając w imieniu podatnika deklarację podatkową za dany okres rozliczeniowy, ma obowiązek pomniejszyć kwotę podatku naliczonego określoną dla tego okresu o podatek naliczony wynikający z faktur, które nie zostały uregulowane i dla których w tym okresie rozliczeniowym upłynął 150 dzień od dnia upływu terminu jej płatności określonego w umowie lub na fakturze. Innymi słowy, syndyk rozlicza to pomniejszenie na bieżąco. Natomiast, gdy w prowadzonym postępowaniu upadłościowym syndyk w trakcie ustalania faktycznego stanu zobowiązań upadłego stwierdzi, że podatnik mimo ciążącego na nim obowiązku nie rozliczył korekty odliczonej kwoty podatku we właściwym okresie, wówczas syndyk będzie musiał zrobić korektę złożonych wcześniej deklaracji. W ocenie urzędników obowiązek składania deklaracji nie ustaje w chwili ogłoszenia upadłości. W czasie trwania postępowania upadłościowego tylko syndyk jest osobą odpowiedzialną za realizację obowiązków podatnika, w tym obowiązków wynikających z ustawy VAT.
Tej wykładni nie potwierdził jednak WSA w Gliwicach. Jego zdaniem
w stanie prawnym obowiązującym od 1 stycznia 2013 r., w przypadku nieuregulowania powstałej przed datą ogłoszenia upadłości należności wynikającej z faktury dokumentującej dostawę towarów lub świadczenie usług na terytorium kraju w terminie 150 dni od dnia upływu terminu jej płatności określonego w umowie lub na fakturze, syndyk masy upadłości, działający