Tak orzekł Naczelny Sąd Administracyjny ?w wyroku z 23 stycznia 2013 r. (I FSK 58/13).
Podatnik wniósł do spółki komandytowej wkład niepieniężny. Na podstawie ?§ 38 rozporządzenia ministra finansów ?z 28 listopada 2008 r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o VAT czynność wniesienia aportu została zwolniona z opodatkowania VAT. ?W związku z tym we wniosku o interpretację podatnik zadał następujące pytanie: czy spółka powinna dokonać korekty naliczonego VAT wynikającej z wniesienia do spółki komandytowej wkładu niepieniężnego zwolnionego z VAT? Podatnik stanął na stanowisku, że zgodnie z regulacjami wspólnotowymi aport jest czynnością opodatkowaną, a polski ustawodawca, wprowadzając do porządku krajowego zwolnienie, naruszył prawo unijne. Jego zdaniem zastosowanie takiego zwolnienia nie może pozbawiać podatnika prawa do odliczenia podatku naliczonego, które to prawo zostało mu przyznane przez prawodawstwo unijne, na co wskazywały wielokrotnie polskie sądy administracyjne. Podatnik nie musi więc dokonywać korekty VAT, gdyż nie może ponosić negatywnych konsekwencji błędu popełnionego przez ustawodawcę.
Organ nie przychylił się do interpretacji przedstawionej przez podatnika. Stwierdził, że podatnik powinien dokonać wyboru pomiędzy zwolnieniem ?a opodatkowaniem. Skorzystanie z pierwszej z tych możliwości pociąga za sobą konieczność dokonania korekty. Podatnik, nie zgadzając się z tym stanowiskiem, wniósł skargę do WSA w Lublinie, który wyrokiem z 26 września 2012 r. (I Sa/Lu 641/12) uchylił interpretację, podzielając stanowisko podatnika. Organ wniósł jednak skargę kasacyjną.
Wydając wyrok w powyższej sprawie, NSA przyznał, że dotychczasowa linia orzecznicza polskich sądów administracyjnych, w tym NSA, była zgodna ze stanowiskiem podatnika. Wskazał na wyrok TSUE z 28 listopada 2013 r. (C-319/12), ?w którym Trybunał w odpowiedzi na pytanie prejudycjalne skierowane przez NSA stwierdził, że prawo do odliczenia VAT nie przysługuje podatnikowi w sytuacji, gdy ten korzysta ze zwolnienia, którego nie przewidują przepisy unijne. Zdaniem NSA spółka powinna więc dokonać korekty naliczonego VAT w związku z wniesieniem do spółki komandytowej wkładu niepieniężnego zwolnionego z VAT.
—Przemysław Smoczyński, współpracownik zespołu zarządzania wiedzą podatkową ?firmy Deloitte