Spór w sprawie dotyczył skutków podatkowych połączenia spółki osobowej z kapitałową. Wnioskodawca – spółka kapitałowa wyjaśniła, że rozważa połączenie ze spółką jawną lub komandytową. Połączenie miałoby nastąpić w trybie art. 492 § 1 pkt 1 kodeksu spółek handlowych (k.s.h.), czyli przez przeniesienie całego majątku przejmowanej spółki osobowej na wnioskodawcę w zamian za udziały (łączenie się przez przejęcie). W wyniku połączenia, część majątku spółki przejmowanej miałaby być przekazana na kapitał zapasowy/rezerwowy wnioskodawcy. Spółka osobowa ma zostać rozwiązana bez przeprowadzania postępowania likwidacyjnego, w dniu wykreślenia z rejestru.
Pytająca spółka tłumaczyła, że połączenie ma być przeprowadzone w trakcie roku podatkowego, nie wcześniej jednak niż w październiku. Zapytała czy połączenie, przeprowadzone w trakcie aktualnego roku podatkowego spółki przejmowanej, skutkujące przejęciem majątku spółki osobowej, będzie wiązało się powstaniem po jej stronie przychodu podatkowego w CIT. Sama uważała, że nie.
Innego zdania był fiskus. Uznał bowiem, że przejęcie spółki osobowej nie będzie dla kapitałowej transakcją neutralną w rozliczeniach CIT. Opisane zdarzenie będzie wiązało się z wejściem do majątku spółki kapitałowej składników majątkowych, które dotychczas były własnością spółki osobowej. Spółka kapitałowa uzyska tym samym definitywny, mierzalny przyrost majątku, który spełnia warunki uznania go za przychód w rozumieniu art. 12 ust. 1 ustawy o CIT.
Rację spółce przyznał dopiero Wojewódzki Sąd Administracyjny w Krakowie. Odwołując się do orzecznictwa WSA uznał, że przejęcie spółki osobowej przez kapitałową nie powoduje powstania po stronie wspólnika spółki osobowej przychodu podlegającego opodatkowaniu CIT. Jak tłumaczył sąd, majątek spółki osobowej jest jej majątkiem. Jednak spółka osobowa nie posiada osobowości prawnej (jest transparentna dla celów podatku dochodowego), a z punktu widzenia prawa podatkowego podatnikami są poszczególni jej wspólnicy. Dlatego należałoby uznać, że każdy z jej wspólników wnosi do spółki kapitałowej majątek odrębnie – w proporcji ustalonej zgodnie z art. 5 ust. 1 ustawy o CIT – w zamian za udziały w podwyższonym kapitale zakładowym spółki kapitałowej.
W ocenie WSA taka sytuacja, będąca z punktu przepisów kodeksu spółek handlowych procesem połączenia spółek, w rozumieniu ustawy o CIT jest wniesieniem wkładu niepieniężnego (aportu) do spółki kapitałowej w zamian za wydane udziały. W takiej sytuacji zastosowanie znajdą przepisy art. 12 ust. 4 pkt 4 oraz pkt 11 ustawy o CIT.
