Wysokość tej opłaty zależy od ilości i jakości pobranej wody, a także od tego, czy pobierano wodę powierzchniową czy podziemną, oraz od jej przeznaczenia. Pobór wody na potrzeby firmy trzeba mierzyć, a urządzenia pomiarowe muszą spełniać wymagania przepisów o miarach. Za brak wymaganego pozwolenia przedsiębiorcy wnoszą opłaty podwyższone.
Przedsiębiorca musi więc prowadzić pomiary i odpowiednią ewidencję. Opłatę oblicza się, mnożąc liczbę metrów sześciennych pobranej wody przez odpowiednie stawki (patrz tabela). Stawka opłaty za wodę podziemną zależy od jej przeznaczenia. Nie można jednak zapomnieć o pomnożeniu przez współczynniki różnicujące zależne od jakości wody. Zależą one od stosowanego procesu uzdatniania.
Jeżeli do uzdatniania tej samej wody stosuje się dwa lub więcej procesów wymienionych wyżej, to przy ustalaniu opłaty przyjmuje się ten proces, przy którym współczynnik różnicujący jest najniższy (wówczas również ustalana w wykazie kwota jest najniższa).
Sposób obliczania opłaty za pobór wody powierzchniowej jest trochę inny. Właściwe stawki i współczynniki są podane w rozporządzeniu w sprawie opłat za korzystanie ze środowiska.
Uwaga! Jeżeli przedsiębiorca korzysta z wody bez wymaganego pozwolenia wodnoprawnego, to ponosi podwyższone opłaty.