Organ, nie dochowując terminów naraża się na zarzut przewlekłości lub innych naruszeń zasad postępowania. Na podatniku z kolei ciąży odpowiedzialność, zagrożona karą porządkową, za niedokonanie złożenia wyjaśnień w terminie czy nieprzedstawienie w wyznaczonym terminie ksiąg podatkowych lub dowodów księgowych.
Z drugiej strony, terminy wskazane w przepisach podatkowych mają też za zadanie zagwarantować kontrolowanemu czynny udział w działaniach organów podatkowych w trakcie kontroli. Przykładowo, kontrolowany powinien być zawiadomiony z odpowiednim wyprzedzeniem o miejscu, terminie przeprowadzenia dowodu z zeznań świadków, opinii biegłych lub oględzin (w trakcie kontroli podatkowej oraz kontroli celno-skarbowej z wyprzedzeniem minimum 3 dniowym).