Dla celów podatków dochodowych, prawo wieczystego użytkowania gruntu, zaliczane do wartości niematerialnych i prawnych, nie podlega amortyzacji (art. 22c pkt 1 ustawy o PIT; art. 16c pkt 1 ustawy o CIT). Amortyzacji podatkowej będą natomiast podlegać budynki, stanowiące własność odrębną od gruntu oddanego w wieczyste użytkowanie (art. 22a ust. 1 pkt 1 ustawy o PIT; art. 16a ust. 1 pkt 1 ustawy o CIT). Wyłączenie prawa wieczystego użytkowania gruntów z amortyzacji podatkowej powoduje powstawanie różnic trwałych, ponieważ prawo to podlega amortyzacji księgowej (art. 28 ust. 1 pkt 1 ustawy o rachunkowości).
Wydatki poniesione w związku z zakupem prawa wieczystego użytkowania gruntu (tzw. opłata pierwsza) będą kosztem podatkowym w chwili jego sprzedaży. Z kolei, opłaty roczne stanowią koszt podatkowy w dacie ich poniesienia (art. 23 ust. 1 pkt 1 lit. a ustawy o PIT; art. 16 ust. 1 pkt 1 lit. a ustawy o CIT).
