Przekazywane agentom stanowisko touroperatorów jest jednoznaczne. Touroperatorzy zgadzają się na wystawienie przez agentów faktur korygujących z zastosowaniem stawki 0 procent, ale z pozostawieniem podstawy opodatkowania, czyli dotychczasowej ceny netto. Taka korekta spowoduje obowiązek zwrócenia touroperatorowi przez agenta nienależnie obliczonego VAT w wysokości 23 procent. Jest to w istocie obniżenie ceny, niekorzystne dla agenta, gdyż powoduje konieczność zwrócenia części wynagrodzenia, a jednocześnie agent musiałby zmniejszony VAT uzyskać z urzędu skarbowego. W ewidencji i deklaracji agenta podatek należny, wynikający z faktur korygujących, byłby wykazany ze znakiem „minus".
Touroperator oddałby urzędowi skarbowemu podatek naliczony (takie faktury korygujące z punktu widzenia nabywcy powodują zmniejszenie podatku naliczonego), ale kwoty te otrzymałby od swojego agenta.
We wspomnianej na wstępie interpretacji indywidualnej z 5 lipca 2019 r. agent uzyskał potwierdzenie odmiennego stanowiska w sprawie podstawy opodatkowania w wystawianych fakturach korygujących – w przypadku umów, w których prowizja została wskazana jako kwota brutto, agent powinien prawidłowo podać kwotę brutto należnego wynagrodzenia jako podstawę opodatkowania, do której zastosuje stawkę 0 procent.
Organ uzasadnił swoje stanowisko treścią art. 29a ust. 1 ustawy o VAT, który przewiduje, że podstawą opodatkowania, z zastrzeżeniem niektórych dalszych przepisów, jest wszystko, co stanowi zapłatę, którą dokonujący dostawy towarów lub usługodawca otrzymał lub ma otrzymać z tytułu sprzedaży od nabywcy, usługobiorcy lub osoby trzeciej, (...). Katalog elementów dodatkowych, wchodzących w skład podstawy opodatkowania, określony został w art. 29a ust. 6. W świetle tego przepisu, podstawa opodatkowania obejmuje m.in. podatki, cła, opłaty i inne należności o podobnym charakterze, z wyjątkiem kwoty podatku.
Wystawienie w opisany sposób faktury korygującej powoduje, że cena brutto wynagrodzenia pozostaje bez zmian, agent uzyskuje jednak korzyść w kwocie podatku należnego. VAT należny wynikający z faktury korygującej zostanie w ewidencji i deklaracji wykazany ze znakiem „minus", ale agent nie oddaje tej kwoty touroperatorowi (nie zmienia ceny – wynagrodzenia). Jednocześnie touroperator, który odliczył 23 procent VAT z pierwotnej faktury, musiałby zmniejszyć podatek naliczony, a przy tym nie odzyskałby żadnych kwot od agenta.
Naliczanie podatku
W razie sporu decydujące będą zapisy umów agencyjnych, dotyczące wynagrodzenia (prowizji). Jeżeli prowizja została wskazana jako kwota brutto i nie zastrzeżono, że touroperator przewidywał stosowanie stawki VAT innej niż 0 procent, to agent ma spore szanse na korzystne dla siebie korygowanie faktur, pozostawiając niezmienioną kwotę brutto.