Zwolnienie z podatku akcyzowego energii wytworzonej z odnawialnych źródeł odbywa się w ten sposób, że najpierw przedsiębiorstwo energetyczne, sprzedając energię nabywcom końcowym, nalicza podatek akcyzowy od całkowitej jej ilości, a następnie nabywa od wytwórców odnawialnych źródeł energii określoną w ustawie o odnawialnych źródłach energii (dalej: ustawa o OZE) liczbę świadectw pochodzenia, które przedstawia do umorzenia Prezesowi Urzędu Regulacji Energetyki. Pomniejszenie wysokości należnego podatku akcyzowego o podatek zapłacony od energii elektrycznej, wytwarzanej z odnawialnych źródeł energii, staje się możliwe dopiero po uzyskaniu decyzji administracyjnej Prezesa URE. Wówczas przedsiębiorca, rozliczając podatek akcyzowy za kolejny okres rozliczeniowy, pomniejsza wysokość należnego podatku akcyzowego o podatek zapłacony od energii elektrycznej wytwarzanej z odnawialnych źródeł energii.