Nowe przepisy ustawy o CIT będą dotyczyły także sfery przekształceń spółek. Rząd chce w ten sposób wyeliminować przypadki restrukturyzacji obliczonej głównie na korzyści podatkowe. Podatku nie trzeba będzie płacić tylko wtedy, gdy wycena podatkowa składników majątkowych danej spółki będzie kontynuowana i nie będzie to kreowało dodatkowych kosztów.
Co do zasady, łączenie, podział spółek oraz wymiana udziałów są neutralne podatkowo. Gwarantuje to unijna dyrektywa 2009/133/WE. Podatku nie płaci się, dopóki takie operacje nie wykreują realnego dochodu przez dany podmiot.. Dochód (przychód) do opodatkowania pojawia się dopiero w momencie odpłatnego zbycia udziałów lub akcji. W takim przypadku kosztem uzyskania przychodu są wydatki na nabycie udziałów (akcji) w spółce przejmowanej lub dzielonej. Jeśli tylko istnieje uzasadnienie ekonomiczne dla takich działań, takie przekształcenia nie przełożą się na obowiązek zapłaty podatku dochodowego.