Rafał Milczarski był prezesem zarządu PLL LOT S.A. od stycznia 2016 roku. Ukończył Wydział Ekonomii Uniwersytetu Cambridge, podczas studiów odbywał praktyki między innymi w bankach UBS w Zurychu oraz JP Morgan w Londynie. Ma międzynarodowe doświadczenie w branży transportowej. Po studiach pracował w dziale logistyki morskiej i kolejowej firmy Foster Yeoman z Wielkiej Brytanii. Współtworzył Kolej Bałtycką, jednego z pierwszych prywatnych kolejowych przewoźników towarów w Polsce. W 2005 roku wraz z inwestorem branżowym Freightliner Group z Wielkiej Brytanii założył firmę Freightliner PL – towarowego przewoźnika kolejowego, którego jako prezes i współwłaściciel poprowadził od startupu do osiągnięcia kilkuprocentowego udziału w rynku przewozów towarowych w Polsce. Jest też założycielem i byłym prezesem Freightliner DE, niemieckiej spółki zależnej Freightliner PL oraz Związku Niezależnych Przewoźników Kolejowych. 

Od 2017 roku Rafał Milczarski jest szefem stowarzyszenia AIRE (Airlines International Representation in Europe), które zrzesza europejskich przewoźników lotniczych, a od grudnia 2017 roku prezesem Polskiej Grupy Lotniczej S.A. W skład PGL wchodzą najważniejsze firmy z branży lotniczej, należące do Skarbu Państwa. To między innymi PLL LOT, LOT AMS oraz LS Airport Services. W sierpniu 2019 roku Rafał Milczarski został powołany do Rady Gubernatorów IATA.

Jednocześnie rada nadzorcza LOT-u wybrała członka zarządu odpowiadającego za sprawy korporacyjne. Od 1 września będzie nim Katarzyna Piskorz, która przez 15 lat pracowała w Grupie PZU , a od ponad dwóch lat kieruje biurem zarządu w spółce PFR Nieruchomości (wcześniej BGK Nieruchomości), zarządzającej aktywami dwóch funduszy inwestycyjnych oraz świadczy usługi operacyjne dla spółek celowych tych funduszy w ramach realizacji programu Mieszkanie Plus. 

Członkiem zarządu ds. ekonomiczno-finansowych został Paweł Rozkrut. Absolwent dwóch krakowskich uczelni - ekonomii na Akademii Ekonomicznej i fizyki na Uniwersytecie Jagiellońskim. Pracował na wcześniej w Unileverze Polska, Grupie Cadbury w Polsce i Wielkiej Brytanii, Cefic Polska, BP Castrol oraz AmeriGas Polska. Jest wieloletnim członkiem ACCA (Association of Chartered Certified Accountants). Stanowisko w LOT obejmie 16 września.