Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej (dyrektor KIS) 5 kwietnia 2018 r. wydał interpretację w przedmiocie możliwości wyłączenia z opodatkowania VAT świadczonej przez gminę usługi najmu pomieszczenia na potrzeby gabinetu profilaktyki zdrowotnej i pomocy przedlekarskiej (sygn. 0112-KDIL2-2.4012.44.2018. 1.AKR).
Wnioskodawcą w omawianej sprawie jest gmina będąca miastem na prawach powiatu. Opisując stan faktyczny, gmina wskazała, że jako jednostka samorządu terytorialnego wykonuje zadania publiczne we własnym imieniu i na własną odpowiedzialność. Jednocześnie, jako miasto na prawach powiatu, gmina wykonuje także nałożone ustawami zadania publiczne o charakterze ponadgminnym. Jednym z zadań publicznych wykonywanych przez gminę na poziomie gminnym jak i powiatowym są zadania w zakresie edukacji publicznej. W celu ich realizacji, gmina może powoływać jednostki organizacyjne, jak również zawierać umowy z innymi podmiotami.
Jak podała gmina, jednostkami organizacyjnymi powołanymi w związku z realizacją ww. zadań z zakresu edukacji są m.in. przedszkola, szkoły, placówki oświatowe, specjalne ośrodki wychowawcze, a także jednostki obsługi ekonomiczno-administracyjnej. Placówki te powoływane są na podstawie przepisów ustawy Prawo oświatowe, zgodnie z którą do zadań statutowych szkół należy zapewnienie uczniom możliwości skorzystania z gabinetu profilaktyki zdrowotnej, spełniającego wymagania określone w ustawie o działalności leczniczej. Gmina wskazała, że w celu zapewnienia dostępu do wspomnianej profilaktyki zdrowotnej dyrektorzy poszczególnych placówek oświatowych zawierają umowy najmu lokali na potrzeby prowadzenia gabinetów, które z kolei wykorzystywane są wyłącznie do świadczenia usług medycznych na rzecz uczniów w zakresie określonym przez Narodowy Fundusz Zdrowia.
Wobec tak przedstawionego stanu faktycznego gmina wystąpiła z pytaniem, czy zawierane umowy najmu podlegają wyłączeniu z zakresu zastosowania VAT jako usługi stanowiące realizację zadań publicznych. Stanowisko gminy ograniczyło się jedynie do stwierdzenia, że opodatkowaniu VAT podlegają wyłącznie czynności gospodarcze spoza zakresu należącego do sfery imperium gminy, wobec czego, zdaniem gminy, najem lokali na potrzeby gabinetów lekarskich powinien podlegać wyłączeniu z opodatkowania VAT, gdyż stanowi realizację zadań publicznych.
Dyrektor KIS nie zgodził się ze stanowiskiem gminy. Uzasadniając swoje stanowisko organ odwołał się do przepisów regulujących podmiotowy zakres zastosowania ustawy o VAT, zaznaczając, że w ich świetle jednostki samorządu terytorialnego mogą występować jako podmioty niebędące podatnikami, gdy realizują zadania nałożone na nie odrębnymi przepisami prawa albo jako podatnicy VAT, gdy wykonują czynności na podstawie umów cywilnoprawnych.