Państwowa Inspekcja Farmaceutyczna składająca się obecnie z głównego inspektora farmaceutycznego oraz 16 wojewódzkich inspektorów farmaceutycznych zostanie zastąpiona jednym centralnym organem administracji rządowej – głównym inspektorem farmaceutycznym (GIF). Wojewódzcy inspektorzy farmaceutyczni staną się pracownikami GIF. Takie zmiany przewiduje projekt nowelizacji prawa farmaceutycznego i niektórych innych ustaw.
Jak uzasadnia resort zdrowia, trzeba zwiększyć efektywność działań inspekcji i zapewnić skuteczny, lepiej skoordynowany nadzór nad rynkiem wewnętrznym – aptekami, hurtowniami, wytwórcami, importerami, dystrybutorami substancji czynnych i pośrednikami w obrocie produktami leczniczymi. Aktualnie zadania PIF na poziomie regionalnym, czyli województwa, są wykonywane przez wojewodę przy pomocy wojewódzkiego inspektora farmaceutycznego jako kierownika wojewódzkiej inspekcji farmaceutycznej, wchodzącej w skład zespolonej administracji wojewódzkiej. Rozproszona struktura może prowadzić do sporów kompetencyjnych pomiędzy wojewódzkimi inspektoratami, szczególnie w sprawach przedsiębiorców działających w kilku województwach, np. sieci aptek. Może to doprowadzić do sytuacji, w której żaden z wojewódzkich inspektoratów nie podejmie działań nadzorczych wobec sieci aptecznych, uznając, że czynności te leżą w kompetencji innych jednostek.