Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego przygotowało projekt nowelizacji niektórych ustaw określających warunki prowadzenia działalności innowacyjnej. Jego celem jest skonstruowanie systemu podatkowego premiującego działalność innowacyjną. Ma wejść w życie 1 stycznia 2017 r.
Jedną z najważniejszych zmian jest zwiększenie kwot kosztów kwalifikowanych. Obecnie w ramach ulgi B+R odliczyć można 30 proc. kosztów wynagrodzeń oraz 20 proc. pozostałych kosztów (w przypadku mikroprzedsiębiorców i małych lub średnich przedsiębiorców MŚP) lub 10 proc. pozostałych kosztów dla pozostałych przedsiębiorców.
Projekt zakłada, że mikroprzedsiębiorcy i MŚP odliczą do 50 proc. wszystkich kosztów kwalifikowanych na działalność B+R. Natomiast pozostałe duże firmy odliczą 50 proc. wydatków osobowych i 30 proc. pozostałych kosztów związanych z działalnością badawczo-rozwojową. Okres korzystania z ulgi B+R zostanie wydłużony z trzech do sześciu lat.
Natomiast w przypadku nowo powstałych firm (start-up), które nie mają dochodów albo wykazują za małe do pełnego odliczenia, proponuje się przyznanie zwrotu gotówkowego. Decyzję podejmowałby podatnik. Chodzi o kwotę wynoszącą 18 proc. (w przypadku podatników PIT) lub 19 proc. (w przypadku podatników CIT lub płacących liniowy PIT) różnicy między kwotą przysługującego odliczenia a kwotą odliczoną w zeznaniu podatkowym.
Projekt zakłada też rozszerzenie listy kosztów kwalifikowanych o koszty uzyskania patentu. Obecnie podatnik może odliczyć koszty wynagrodzeń pracowników; nabycie materiałów i surowców bezpośrednio związanych z prowadzoną działalnością badawczo-rozwojową; ekspertyzy i opinie. Projekt zakłada rozszerzenie tej listy o koszty uzyskania patentu na wynalazek, takie jak: koszty przygotowania dokumentacji zgłoszeniowej, prowadzenia postępowania o udzielenie patentu przez Urząd Patentowy RP lub odpowiedni zagraniczny organ.