Zwolnienie z VAT zależy od celu usługi medycznej. Zdaniem Izby Skarbowej w Łodzi cel ten jest inny, gdy na te same badania zgłasza się ochroniarz ze skierowaniem, i inny, gdy skierowania nie przyniesie.
Z pytaniem do Izby zwrócił się publiczny zakład opieki zdrowotnej, czynny podatnik VAT. Zakład wykonuje badania osób ubiegających się o wpis lub posiadających wpis na listę kwalifikowanych pracowników ochrony fizycznej. Chodzi m.in. o badania lekarskie ogólne, specjalistyczne okulistyczne i na obecność zaburzeń psychicznych oraz badania psychologiczne oceniające sprawność intelektualną i umiejętność funkcjonowania w trudnych sytuacjach.
Część osób na badania przychodzi ze skierowaniami od pracodawców, ale część takich skierowań nie posiada. Obowiązek ich przeprowadzania wynika z ustawy o ochronie osób i mienia. Na listę kwalifikowanych pracowników ochrony fizycznej można wpisać tylko osoby mające odpowiednie zdolności fizyczne i psychiczne, stwierdzone orzeczeniami lekarskim i psychologicznym, których ważność nie upłynęła.
Z tego powodu część pacjentów wysyłają na badania pracodawcy, a inni, by utrzymać uprawnienia, sami przedłużają ich ważność.
Zwolnione z VAT są z kolei, na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 18 ustawy o VAT, usługi w opiece medycznej służące profilaktyce, zachowaniu, ratowaniu, przywracaniu i poprawie zdrowia, wykonywane w działalności leczniczej przez podmioty lecznicze.