W 2017 r. do prokuratur krakowskiego okręgu regionalnego wpłynęło ponad 101 tys. spraw karnych.
Najbardziej obciążone prokuratury (licząc miernikiem średniego miesięcznego obciążenia sprawami na jednego prokuratora) to Prokuratura Rejonowa w Brzesku (ponad 30 spraw) oraz prokuratury rejonowe w Chrzanowie i Miechowie (ponad 27 spraw). Najciekawsze sprawy wpływają jednak do jednostek największych. Przykłady?
Pod koniec grudnia 2017 r. do Sądu Okręgowego w Krakowie skierowany został akt oskarżenia w sprawie przeciwko Marcinowi Dubienieckiemu oraz ośmiorgu jego wspólnikom.
Zarzucono im wyłudzenie w ramach działania zorganizowanej grupy przestępczej kwoty ponad 14 mln zł na szkodę Państwowego Funduszu Rehabilitacji Osób Niepełnosprawnych. Jak mieli działać? Chodziło o wykorzystanie fikcyjnego zatrudnienia w działalności gospodarczej osób niewidomych. To tylko jedna z głośnych medialnych spraw.
Kolejna dotyczy wyłudzenia wielomilionowych dotacji. Chodzi o śledztwo w sprawie wyłudzenia ponad 40 mln zł pochodzących z unijnych dotacji na sfingowane przedsięwzięcia gospodarcze. Miały być prowadzone przez firmy z terenu województwa świętokrzyskiego.
W śledztwie tym w charakterze podejrzanych występuje już prawie 30 osób. Ma ono charakter rozwojowy.
I kolejna z głośnych spraw: w toku jest śledztwo związane z przestępstwami o charakterze korupcyjnym dokonanymi w związku z działalnością Powiatowego Zarządu Dróg w Nowym Targu. Od kilku miesięcy w tymczasowym areszcie pozostają trzy osoby z kierownictwa tej instytucji: dyrektor, jego zastępca oraz kierownik działu zamówień publicznych.
W Prokuraturze Regionalnej w Krakowie kontynuowane jest śledztwo dotyczące domniemanych więzień CIA na terenie Polski oraz niedozwolonych działań operacyjnych (obejmujące tzw. wątek inwigilacji dziennikarzy) prowadzonych przez funkcjonariuszy służb specjalnych.
Z domniemaniem, że w Polsce – i w kilku innych krajach europejskich – mogły być tajne więzienia CIA, wystąpiła w 2005 r. organizacja Human Rights Watch. Według niej takie więzienie w Polsce miało się znajdować na terenie szkoły wywiadu w Kiejkutach lub też w pobliżu lotniska wojskowego w Szymanach na Mazurach.
W prowadzonym od sierpnia 2008 r. śledztwie Prokuratura Regionalna w Krakowie (wcześniej Prokuratura Apelacyjna, od 4 marca 2016 r. przekształcona w Regionalną) bada, czy była zgoda polskich władz na stworzenie w Polsce tajnych więzień CIA w latach 2002–2003.