Zasady wynagradzania nauczycieli akademickich reguluje prawo o szkolnictwie wyższym z 27 lipca 2005 r. (DzU nr 164, poz. 1365 ze zm.). Zgodnie z jego art. 154 za czas niezdolności do pracy wskutek choroby nauczyciel akademicki dostaje wynagrodzenie obliczane na zasadach przewidzianych w art. 92 kodeksu pracy. Przepis ten wszedł w życie 1 września 2006 r.
Art. 154 ust. 2 prawa o szkolnictwie wyższym nie daje podstaw do przyjęcia, ze od tego dnia nauczyciel akademicki nabywa za czas choroby prawo do wynagrodzenia, o którym mowa w art. 92 kodeksu pracy, oraz do zasiłku chorobowego finansowanego z Funduszu Ubezpieczeń Społecznych.
Według ministra nauki i szkolnictwa wyższego (pismo z 30 sierpnia 2006 r., DP-123-2249/06) nadal im przysługuje prawo do wynagrodzenia obliczanego na zasadach przewidzianych w art. 92 kodeksu pracy wypłacanego ze środków uczelni.
W świetle art. 124 pkt 1 ustawy rektor może rozwiązać za wypowiedzeniem stosunek pracy z mianowanym nauczycielem akademickim, jeżeli choroba przekracza okres zasiłkowy, czyli 182 dni albo 270 dni gdy chodzi o gruźlicę. Jeśli lekarz stwierdzi poprawę stanu zdrowia i możliwość powrotu do pracy, rozstanie jest dopuszczalne dopiero po dwóch latach takiej absencji.
Nauczyciele akademiccy zatrudnieni na podstawie mianowania zachowują zatem przez tyle czasu normalne wynagrodzenie.