Yunupingu zmarł w swoim domu na Terytorium Północnym w wyniku ciężkiej choroby nerek.
Mandawuy Yunupingu był znaczącą postacią, której muzyka pomogła stworzyć porozumienie między białymi mieszkańcami Australii i Aborygenami. Jemu także przypisuje się wprowadzenie rodzimej muzyki do kultury popularnej, jego piosenki miały status przeboju.
To wszystko pomogło muzykowi w zdobyciu w 1992 roku tytułu Człowieka Roku w Australii.
- Straciliśmy wyjątkowego muzyka, zasłużonego ambasadora Aborygenów i naprawdę wielkiego przyjaciela - powiedziała premier Julia Gillard.
Były wokalista zespołu Midnight Oil Peter Garret, który jest teraz ministrem edukacji, nazwał zmarłego "liderem i światełkiem przewodnim dla swego ludu".