Biskup nie ma wątpliwości, że świątynia, uznana w 1984 roku przez UNESCO za światowe dziedzictwo ludzkości, jest katolicką katedrą. – To miejsce kultu katolików od ośmiu wieków – powiedział w wywiadzie udzielonym konserwatywnemu dziennikowi „ABC”.
Spór o świątynię ciągnie się od marca 2004 roku, gdy pojawiły się pierwsze pomysły, żeby w świątyni modlili się zarówno katolicy, jak i wyznawcy islamu. Biskup Kordoby stanowczo odrzucił wówczas ten pomysł. „Dzielenie świątyni z muzułmanami jest nie do zaakceptowania” – oświadczył wówczas Demetrio Fernández.
Świątynia została zbudowana przez muzułmanów w VIII w. na miejscu kościoła katolickiego. W ręce katolików wróciła w 1236 r. po odzyskaniu miasta przez króla Ferdynanda III Świętego. W 1523 r. zyskała rangę katedry.