Postępowanie przed wojewódzką komisją rozpoczyna się od złożenia odpowiedniego wniosku. Pacjent, który zdecyduje się dochodzić odszkodowania w przyspieszonym trybie, powinien dokładnie przygotować się do procedury od strony technicznej. Wniosek należy złożyć w komisji właściwej ze względu na siedzibę szpitala. Na dochodzenie odszkodowania poszkodowany ma rok od dnia, w którym dowiedział się o swoimi zakażeniu, uszkodzeniu ciała itp. Rok mają także spadkobiercy pacjenta, który zmarł. Przepisy wskazują jednocześnie, że okres ten nie może być dłuższy niż trzy lata od dnia, w którym zdarzenie nastąpiło.
Sam wniosek trzeba dobrze uzasadnić. Pacjent powinien w dokumencie uprawdopodobnić, że jego zdrowie pogorszyło się przez wydarzenie w szpitalu. Ma także wskazać, czego dotyczy wniosek, tzn. czy doszło do zakażenia, uszkodzenia ciała, rozstroju zdrowia czy śmierci.
W samym wniosku zainteresowany musi wskazać swoje dane lub nazwiska wszystkich spadkobierców, ze wskazaniem, który z nich będzie reprezentował pozostałych przed komisją. Potrzebne są także dane szpitala. Zainteresowany ma określić swoją propozycję odszkodowania, ale nie wyższą niż 100 tys. zł za zakażenie bądź uszkodzenie ciała lub 300 tys. zł za śmierć.
Wniosek powinien też zawierać załączniki. Chodzi o dowody potwierdzające wskazane w nim okoliczności, np. wyniki badań. Przyda się także ewentualne stwierdzenie nabycia spadku oraz pełnomocnictwo do reprezentowania pozostałych spadkobierców.
Za złożenie wniosku trzeba zapłacić 200 zł. Opłatę wnosi się na rachunek właściwego urzędu wojewódzkiego, a potwierdzenie jej uiszczenia dołącza do wniosku. To ważne, ponieważ wniosek niekompletny i nienależycie opłacony urząd wojewódzki zwróci wnioskodawcy bez rozpatrzenia.