Gmina wyjaśniła, że wykonuje jednocześnie czynności podlegające VAT na zasadach ogólnych, czynności zwolnione, a także czynności niepodlegające opodatkowaniu. W 2012 r. przebudowała oraz zmodernizowała targowisko. Dotychczas nie odliczyła VAT naliczonego przy zakupie towarów oraz usług związanych z targowiskiem. Zauważyła jednak, że w związku z jego funkcjonowaniem świadczy usługę, polegającą na rezerwacji stoisk handlowych, w zamian za uiszczenie tzw. opłaty rezerwacyjnej. Ponadto gmina zaznaczyła, że pobiera również opłatę targową od podmiotów handlujących na targowisku. Opłata ma charakter daniny publicznoprawnej, a w zakresie jej poboru gmina nie działa jako podatnik VAT.
Gmina zapytała, czy w związku z prowadzeniem działalności opodatkowanej na terenie targowiska ma prawo do odliczenia całej kwoty VAT wykazanej na fakturach związanych z realizacją inwestycji.
Fiskus odpowiedział, że gminie nie przysługuje i nie będzie przysługiwać pełne prawo do odliczenia podatku naliczonego związanego z przebudową oraz modernizacją targowiska.
Samorządowcy zaskarżyli interpretację, a Wojewódzki Sąd Administracyjny w Poznaniu ją uchylił. W jego ocenie nie budzi wątpliwości to, że gmina z tytułu odpłatnej rezerwacji miejsc targowych jest podatnikiem VAT. Świadczenia te odbywają się bowiem na podstawie umów, zawieranych przez nią z poszczególnymi podmiotami handlującymi. Wystąpiło zatem odpłatne świadczenie usług podlegające opodatkowaniu VAT. W zakresie opłaty targowej WSA przyjął natomiast, że z tytułu jej poboru gmina nie wykonuje czynności opodatkowanych. Czynność ta związana jest z wykonywaniem zadań publicznych nałożonych odrębnymi przepisami. W tym zakresie gmina działa jako organ władzy publicznej i nie może być uznana za podatnika VAT.
Sąd uznał jednak, że w sytuacji wykonywania przez gminę czynności z zakresu poboru opłaty targowej i jednocześnie czynności opodatkowanych VAT (pobierania opłat rezerwacyjnych), targowisko było w całości wykorzystywane do celów działalności gospodarczej, z uwagi na wyłączenie czynności poboru opłaty targowej spod zakresu regulacji ustawy o VAT.