Projekt ten przewiduje możliwość powoływania przez Prezesa NFZ specjalnych zespołów koordynacyjnych, które będą m.in. kwalifikowały pacjentów do programów lekowych z wykorzystaniem leków refundowanych oraz podejmowały decyzje o wyłączeniu pacjenta z takiego programu.
W przypadku niektórych leków – z reguły wyjątkowo drogich – takie zespoły koordynacyjne już obecnie funkcjonują. Podstawa prawna ich działalności nie znajduje się jednak w żadnej ustawie, lecz w decyzjach o refundacji niektórych leków oraz wydawanym na ich podstawie obwieszczeniu Ministra Zdrowia o wykazie leków refundowanych. Rozstrzygnięcie podejmowane przez zespoły nierzadko decyduje wręcz o życiu pacjentów, ponieważ tylko w ramach programu lekowego osoba chora może uzyskać dany lek po preferencyjnej cenie. Nabycie leków bez refundacji jest natomiast w bardzo wielu przypadkach całkowicie nierealne, gdyż ich koszt przekracza czasami nawet milion złotych rocznie. Dlatego to niezwykle istotne, aby decyzje w sprawie kwalifikacji do i wyłączania z programu były podejmowane w sposób obiektywny i transparentny.