W księgach parafialnych i innych dokumentach kościelnych znajdują się informacje niezbędne dla prowadzenia działalności statutowej Kościoła prawosławnego. Obejmują one zarówno dane zwykłe, jak i te szczególnie chronione.
Generalny inspektor ochrony danych osobowych oraz Sobór Biskupów opracowali specjalny dokument „Ochrona danych osobowych w działalności Polskiego Autokefalicznego Kościoła Prawosławnego". Został on podpisany przez Wojciecha Rafała Wiewiórowskiego, GIODO, oraz arcybiskupa Sawę, zwierzchnika Polskiego Autokefalicznego Kościoła Prawosławnego. Jest to swoisty kodeks dobrych praktyk stanowiący zbiór zasad dotyczących ochrony danych w Kościele.
Przykładowo dokument zaleca, aby administrator danych (na przykład biskup, proboszcz) opracował w formie pisemnej instrukcję zawierającą zasady i praktyczne wyjaśnienia dotyczące sposobu przetwarzania i ochrony danych osobowych. Odnosi się to zarówno do tradycyjnego systemu ich przechowywania (system papierowy), jak i informatycznego.
Warto dodać, że nie jest to pierwszy zainicjowany przez GIODO dokument dotyczący przetwarzania danych na potrzeby Kościoła. Już w 2009 r. wraz z Sekretariatem Konferencji Episkopatu Polski opracowana została instrukcja „Ochrona danych osobowych w działalności Kościoła katolickiego w Polsce".
