Porównywany do mistrza kubizmu Husain pochodził z muzułmańskiej rodziny. Malował często, szybko i barwnie. Inspirował i bulwersował. Zaczynał w latach 40. jako awangardowy twórca w nowej, niepodległej republice. Od lat 50. jego prace goszczą w galeriach na świecie. Już w latach 70. malował hinduskie boginie jako nagie kobiety, ale krytyka spadła na niego dopiero w 1996 r., gdy nad Gangesem rosły wpływy hinduskich nacjonalistów. Padł ofiarą ataków politycznych, grożono mu śmiercią, jego studio i część prac zostały zniszczone.
W 2006 r. obraz "Mother India", przedstawiający nagą kobietę ułożoną w kształt indyjskiej mapy, znów oburzył skrajną prawicę. Malarz przeprosił za płótno, po czym wyemigrował. Mieszkał w Dubaju i Londynie, gdzie zmarł w wieku 95 lat. W 2008 r. indyjski Sąd Najwyższy oddalił kierowane przeciw niemu oskarżenia, podkreślając, że prace Husaina nie były bluźniercze, a nagość jest tradycyjnie obecna w indyjskiej ikonografii. M.F. Husain był członkiem indyjskiego parlamentu i laureatem państwowych odznaczeń.
