Ekspresowe powołanie samego Funduszu Kompensacyjnego nastawione jest na konkretny efekt: uspokojenie nastrojów społecznych i przekonanie jak najwięcej osób do szczepień. Kompensatowane mają być jedynie niepożądane odczyny poszczepienne (NOP) lub wstrząsy anafilaktyczne, które wymagały minimum 14-dniowej hospitalizacji.
Tymczasem największą obawą formułowaną przez zwykłych obywateli, ale również środowiska medyczne są długofalowe skutki, a nie tylko niepożądane odczyny poszczepienne. Fundusz nie będzie obejmować oceny i wypłat z tytułu odległych powikłań, takich jak: wpływ na funkcje rozrodcze, choroby autoimmunologiczne, nowotworowe.