Dlatego powinny starać się o przyznanie środków na jego ochronę zarówno z regionalnych, jak i krajowych programów.
W latach 2004 - 2006 samorządy chętnie sięgały po unijne fundusze na poprawę jakości wód powierzchniowych, powietrza, racjonalizację gospodarki odpadami oraz ochronę powierzchni ziemi. W ramach Zintegrowanego Programu Operacyjnego Rozwoju Regionalnego udało się wybudować lub zmodernizować prawie 1300 km wodociągów i prawie 1500 km kanalizacji. Zbudowano również 70 oczyszczalni ścieków, wprowadzono w życie 25 projektów dotyczących selektywnej zbiórki odpadów oraz recyklingu, zmodernizowano także dwie elektrownie wykorzystujące odnawialne źródła energii.
W latach 2007 -2015 projekty infrastrukturalne związane z ochroną środowiska nadal będą otrzymywały wsparcie. Samorządy mają do dyspozycji prawie 5 mld euro z programu "Infrastruktura i środowisko". Część tych środków będzie przeznaczona na tzw. indywidualne projekty kluczowe. Możliwe będą jednak również inwestycje wybierane w procedurze konkursowej, w której startować mogą jednostki samorządu terytorialnego. Od ich inicjatywy oraz jakości projektów zależeć będzie, co i za jakie środki powstanie w poszczególnych regionach.
Projekty współfinansowane z tego programu dotyczyć mogą głównie gospodarki wodno-ściekowej, ograniczenia wytwarzania odpadów komunalnych, upowszechniania recyklingu oraz zapobiegania zagrożeniom ekologicznym. Są to bowiem obszary działania, które nadal potrzebują unijnego wsparcia.
Samorządy powinny starać się ośrodki na budowę i modernizację oczyszczalni ścieków komunalnych oraz modernizację systemów kanalizacji zbiorczej w swoich miejscowościach (działanie 1.1 "Gospodarka wodno-ściekowa w aglomeracjach"), a także na organizowanie punktów selektywnego zbierania odpadów, recyklingu oraz dostosowywanie istniejących składowisk odpadów do obowiązujących przepisów (działanie 2.1 "Kompleksowe przedsięwzięcia z zakresu gospodarowania odpadami komunalnymi ze szczególnym uwzględnieniem odpadów niebezpiecznych").