Zgodnie z ogólną zasadą podatnik może odliczyć VAT naliczony związany ze sprzedażą opodatkowaną. Wynika ona z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.
Związek podatku naliczonego ze sprzedażą jest podstawową przesłanką, której spełnienie umożliwia odliczenie podatku naliczonego i ewentualny jego zwrot. Reguła ta dotyczy także gmin oraz innych jednostek samorządu terytorialnego (ewentualnie ich jednostek organizacyjnych).
W zakresie, w jakim gminy (inne jednostki samorządu terytorialnego) są podatnikami, przysługuje im więc generalnie prawo do odliczenia podatku naliczonego. Warto o tym pamiętać. Jest to szczególnie istotne, gdy prowadzone są inwestycje.
Te zwykle związane są z dużymi wydatkami. Oznacza to, że w fakturach od wykonawców wykazane są również znaczne kwoty podatku naliczonego.
Koszty kwalifikowane
Jednocześnie często – przynajmniej w części – inwestycje finansowane są ze środków pomocowych (w tym ze środków unijnych). Wówczas gmina uzyskuje finansowanie tzw. kosztów kwalifikowalnych inwestycji.