Komputerowa gra o Nobla

Naukowcy z University of Washington chcą wykorzystać zabawę w Internecie do poważnego celu: badania struktury białek. Jeśli zamierzenia uczonych się sprawdzą, już wkrótce może powstać skuteczna terapia przeciwko wirusowi HIV.

Aktualizacja: 11.05.2008 00:49 Publikacja: 09.05.2008 19:05

Model prionu, białka, które wywołuje chorobę szalonych krów (BSE)

Model prionu, białka, które wywołuje chorobę szalonych krów (BSE)

Foto: EAST NEWS

Gra nazywa się "Foldit". To chytry pomysł wykorzystania potrzeby rywalizacji między grającymi dla ściśle naukowego celu. Reguły gry są równie proste jak popularnej gry komputerowej "Tetris". Elementy gry trzeba ułożyć w określonym porządku, aby uzyskać obraz końcowy. Elementami w grze "Foldit" są schematy łańcuchów białkowych, które obecne są w każdej komórce naszego organizmu.

Łańcuchy te przyjmują postać nitek, które w procesie tzw. zwijania białek przyjmują sztywną strukturę, co jest niezbędnym warunkiem, aby białko pełniło właściwą rolę biochemiczną. Na ekranie gracz widzi plątaninę nitek, a jego zadaniem jest dopasowanie do siebie kolejnych elementów. Aby opanować grę, wystarczy 20 minut.

"Foldit" oferuje podobne możliwości jak inne gry w Internecie: gracze mogą tworzyć własne profile, budować zespoły, mogą też ze sobą rozmawiać.

Nauka zna ponad 100 tys. różnych ludzkich białek, które wchodzą w skład każdej komórki. Odgrywają one zasadniczą rolę we wszystkich procesach biologicznych, biorą udział w transporcie wielu cząsteczek i jonów (np. hemoglobina przenosząca tlen), służą jako przeciwciała oraz przekazują impulsy nerwowe. Naukowcy znają wiele genetycznych sekwencji białek, nie wiedzą do końca, jak powstają większe struktury pełniące ważne funkcje biologiczne. Symulacje komputerowe, które doprowadziłyby do trafienia na właściwy kształt białka, musiałyby trwać latami.

– Mamy nadzieję zmienić sposób, w jaki osiągamy wyniki naukowe, oraz osoby, które w takich badaniach uczestniczą – powiedział Zoran Popovic, jeden z twórców gry. – Naszym ostatecznym celem jest zainteresowanie grą jak największej liczby zwyczajnych ludzi. Mogą być oni kandydatami do Nagrody Nobla.

Pomysł gry to wspólne dzieło doktorantów inżynierskich studiów wydziału informatycznego University of Washington – Setha Coopera, Adriena Treuillea, Zorana Popovica, wizytującego profesora na tym wydziale, oraz Davida Bakera, profesora biochemii z Howard Hughes Medical Institute. Do współpracy zaproszeni też zostali projektanci gier komputerowych.

Program naukowy został opracowany przez Davida Bakera. Skorzystał on z doświadczeń projektu Rosetta[AT]home, w którym poprosił ochotników o udział w projektowaniu modeli białek. Liczba zgłoszonych 200 tys. uczestników okazała się jednak wtedy niewystarczająca. Oprogramowanie służące do modelowania struktur białek, wykorzystane w programie Rosetta[AT]home, znalazło zastosowanie także w grze "Foldit".

Do posługiwania się oprogramowaniem wykorzystywanym do budowania modeli potrzebne są zupełnie inne cechy, niż wymagane są od biologów.

– Mój 13-letni syn jest szybszy w procesie modelowania białek niż ja sam – przyznał Baker. Naturalne zdolności do budowania modeli mają ci, którzy potrafią wyobrazić je sobie w trzech wymiarach.

Niektórzy ludzie potrafią już w ciągu dwóch minut uzyskać najwyższą liczbę punktów – powiedział Popovic.Choć nie umieją oni wytłumaczyć, jak im się to udało. Wersją testową gry bawiło się dotąd 1000 internautów. W przyszłym tygodniu wolontariusze zmierzą się z profesjonalistami, naukowcami z całego świata zajmującymi się modelowaniem białek.

Pomysłodawcy mają nadzieję, że dzięki masowemu udziałowi graczy uda się zbudować modele białek, których jeszcze naukowcy nie znają, i wykorzystać je w leczeniu AIDS/HIV lub innych chorób. Gracze o najwyższej liczbie punktów będą współautorami prac naukowych i kandydatami do nagród naukowych.

Gra nazywa się "Foldit". To chytry pomysł wykorzystania potrzeby rywalizacji między grającymi dla ściśle naukowego celu. Reguły gry są równie proste jak popularnej gry komputerowej "Tetris". Elementy gry trzeba ułożyć w określonym porządku, aby uzyskać obraz końcowy. Elementami w grze "Foldit" są schematy łańcuchów białkowych, które obecne są w każdej komórce naszego organizmu.

Łańcuchy te przyjmują postać nitek, które w procesie tzw. zwijania białek przyjmują sztywną strukturę, co jest niezbędnym warunkiem, aby białko pełniło właściwą rolę biochemiczną. Na ekranie gracz widzi plątaninę nitek, a jego zadaniem jest dopasowanie do siebie kolejnych elementów. Aby opanować grę, wystarczy 20 minut.

Nauka
W organizmach delfinów znaleziono uzależniający fentanyl
https://track.adform.net/adfserve/?bn=77855207;1x1inv=1;srctype=3;gdpr=${gdpr};gdpr_consent=${gdpr_consent_50};ord=[timestamp]
Nauka
Orki kontra „największa ryba świata”. Naukowcy ujawniają zabójczą taktykę polowania
Nauka
Radar NASA wychwycił „opuszczone miasto” na Grenlandii. Jego istnienie zagraża środowisku
Nauka
Jak picie kawy wpływa na jelita? Nowe wyniki badań
Materiał Promocyjny
Bank Pekao wchodzi w świat gamingu ze swoją planszą w Fortnite
Nauka
Północny biegun magnetyczny zmierza w kierunku Rosji. Wpływa na nawigację