Jeśli podczas kontroli urzędnicy stwierdzą, że rolnik nie przestrzega wymagań, płatności bezpośrednie zostaną zredukowane proporcjonalnie do naruszeń. W przypadku, gdy stwierdzona niezgodność wyniknie z zaniedbania ze strony rolnika, obniżka ta wyniesie 3 proc. całkowitej kwoty płatności bezpośrednich. Jednak może zostać wydana decyzja o obniżeniu wielkości potrącenia do 1 proc. lub zwiększeniu go do 5 proc. całkowitej kwoty.