Niezależnie od powodów, które leżały u podstaw wydalenia Pana Alkhawlany, w tej sprawie pojawił się również szereg problemów proceduralnych. Przede wszystkim postępowania prowadzone wobec Pana Alkhawlany oparte były niejawne dokumenty natomiast decyzje wydawane w tej sprawie nie zawierały uzasadnienia faktycznego odnoszącego się do kwestii objętych tajemnicą. Należy podkreślić, że nie jest to pierwsza tego typu sprawa i stanowi ona nie tyle ilustrację działań organów w tej konkretnej sprawie, ale wskazuje na problem leżący w przepisach prawa krajowego. Istnieją bowiem wątpliwości co do ich zgodności z prawem UE oraz Europejską Konwencją Praw Człowieka.