Janusz Cieszyński pełnił funkcję podsekretarza stanu w Ministerstwie Zdrowia w latach 2018-2020. Odpowiadał m.in. za cyfryzację ochrony zdrowia, w tym za nadzór nad Centrum Systemów Informacyjnych Ochrony Zdrowia Był również członkiem Komitetu Rady Ministrów do spraw Cyfryzacji przy premierze.

Cieszyński odpowiadał za podpisanie umowy na ponad 1200 respiratorów z firmą E&K, która według części mediów miała należeć do handlarza bronią. Wpłacono za nie 154 mln zł zaliczki. Firma z umowy się nie wywiązała, dostarczając zaledwie 200 sztuk respiratorów. Stowarzyszenie Watchdog Polska ujawniło dokumenty wskazujące, że dostarczony sprzęt był wadliwy i brakowało w nim wyposażenia.

W sierpniu 2020 Cieszyński zrezygnował z pełnienia funkcji podsekretarza stanu w Ministerstwie Zdrowia.

W listopadzie 2020 został wiceprezydentem Chełma.

W kwietniu 2021 powrócił do pracy dla rządu, jako wiceprzewodniczący rady ds. Cyfryzacji przy premierze Morawieckim.

Jest członkiem Prawa i Sprawiedliwości.