Dokonano pełnego zsekwencjonowania genomu ziemniaka

Ziemniak nie ma już tajemnic przed badaczami, udało im się odczytać jego pełny genom. Wiadomość o tym zamieszcza prestiżowe pismo naukowe „Nature”.

Publikacja: 11.07.2011 18:10

Dokonano pełnego zsekwencjonowania genomu ziemniaka

Foto: Fotorzepa, Dariusz Majgier DM Dariusz Majgier

Prace nad tym zagadnieniem rozpoczęli już w grudniu 2006 roku naukowcy z Wydziału Hodowli Roślin Uniwersytetu Wageningen w Holandii. Wkrótce dołączyli do nich badacze z kilkunastu krajów i utworzyli PGSC — Potato Genome Sequencing Consortium (www.potatogenome.net), którego członkiem został także Instytut Biochemii i Biofizyki Polsksiej Akademii Nauk. Prace polskich uczonych finansowało Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego w ramach Narodowego Projektu Sekwencjonowania Genomu Ziemniaka.

Ziemniak, (Solanum tuberosum) — zawiera 12 chromosomów i 840 milionów par zasad DNA (co odpowiada mniej więcej jednej czwartej genomu człowieka). Badacze przeskanowali materiał genetyczny ziemniaka 70 razy aby mieć pewność, że żaden fragment genomu nie został przeoczony lub błędnie odczytany.

W trakcie badań pojawiły się nowe, ultraszybkie techniki sekwencjonowania genomów, z których skorzystali badacze w ramach PGSC. Naukowcy stosowali trzy niezależne tzw. platformy sekwencjonujące. Połączenie uzyskanych rezultatów i złożenie ich w ciągłe nici DNA umożliwił specjalny program komputerowy stworzony w Pekińskim Instytucie Genomiki.

Pierwsze, bardzo zachęcające rezultaty zostały zaprezentowane jeszcze dwa lata temu w Carlow w Irlandii.

Ziemniak, należący do rodziny Solanaceae, jest blisko spokrewniony z pomidorem, papryką i bakłażanem. Jest najważniejszą uprawną rośliną warzywną na świecie, a trzecią w ogóle, po ryżu i pszenicy. Największym producentem ziemniaka są Chiny, Polska zajmuje siódme miejsce.

Poznanie sekwencji genomu tej rośliny, a więc jej „planu działania” wskazującego na mechanizmy rządzące wzrostem, pozwoli na wyhodowanie odmian bardziej wydajnych i odpornych na choroby, szkodniki, warunki środowiskowe, szybciej rosnących i o większej wartości odżywczej. Poza tym, znajomość pełnego zapisu informacji genetycznej ziemniaka pozwoli znacząco przyspieszyć tworzenie jego nowych odmian — dziś wyhodowanie nowej odmiany zajmuje 10 do 12 lat.

 

 

Prace nad tym zagadnieniem rozpoczęli już w grudniu 2006 roku naukowcy z Wydziału Hodowli Roślin Uniwersytetu Wageningen w Holandii. Wkrótce dołączyli do nich badacze z kilkunastu krajów i utworzyli PGSC — Potato Genome Sequencing Consortium (www.potatogenome.net), którego członkiem został także Instytut Biochemii i Biofizyki Polsksiej Akademii Nauk. Prace polskich uczonych finansowało Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego w ramach Narodowego Projektu Sekwencjonowania Genomu Ziemniaka.

Ziemniak, (Solanum tuberosum) — zawiera 12 chromosomów i 840 milionów par zasad DNA (co odpowiada mniej więcej jednej czwartej genomu człowieka). Badacze przeskanowali materiał genetyczny ziemniaka 70 razy aby mieć pewność, że żaden fragment genomu nie został przeoczony lub błędnie odczytany.

Nauka
W organizmach delfinów znaleziono uzależniający fentanyl
https://track.adform.net/adfserve/?bn=77855207;1x1inv=1;srctype=3;gdpr=${gdpr};gdpr_consent=${gdpr_consent_50};ord=[timestamp]
Nauka
Orki kontra „największa ryba świata”. Naukowcy ujawniają zabójczą taktykę polowania
Nauka
Radar NASA wychwycił „opuszczone miasto” na Grenlandii. Jego istnienie zagraża środowisku
Nauka
Jak picie kawy wpływa na jelita? Nowe wyniki badań
Materiał Promocyjny
Bank Pekao wchodzi w świat gamingu ze swoją planszą w Fortnite
Nauka
Północny biegun magnetyczny zmierza w kierunku Rosji. Wpływa na nawigację