Wykopaliskami w bazylice św. Jakuba Apostoła, jednego z najstarszych kościołów w mieście,  kieruje dr Krystyna Sulkowska-Tuszyńska. jej budową rozpoczęto w 1309 roku. toruńscy naukowcy planują przeprowadzenie termoluminescencyjnych badań cegieł z tak zwanych  odsadzek  (występów ścian) fundamentów. Dzięki temu możliwe będzie bardzo szczegółowe  ustalenie, z dokładnością do roku, kolejnych faz wznoszenia bazyliki.

Wykopaliska prowadzone są w pobliżu prezbiterium. Archeolodzy natknęli się tam na groby mieszczan grzebanych od średniowiecza do XVIII wieku.

— W wielu grobach odkryliśmy pozostałości tak zwanych wianków grobowych, z którymi chowano zmarłe dzieci, panny a nawet kawalerów - powiedziała archeolog Anna Cicha, biorąca udział w wykopaliskach.

Wszystkie odkopane szkielety zbadają antropolodzy. Przeprowadzone zostaną również badania palinologicze (pyłki drzew, krzewów i innych roślin) świadczące o klimacie.

Nie tylko średniowieczne przedmioty i obiekty wzbudzają zainteresowanie archeologów. Do ciekawych odkryć zaliczają XIX-wieczne wyposażenie zakrystii, między innymi stojący metalowy krucyfiks i fragmenty szklanych naczyń liturgicznych.

Badana przez archeologów świątynia jest siedzibą parafii. W latach 1557 - 1667 była to parafia ewangelicka. Przez kilka stuleci świątynia pełniła funkcję kościoła klasztornego dla pobliskiego zakonu cystersek, a później benedyktynek.