W ocenie Najwyższej Izby Kontroli organizacja i wyposażenie granicznych jednostek Służby Celnej zapewnia zdolność tych jednostek do realizacji obowiązków wynikających z członkostwa Polski w UE, w tym z przystąpienia do Układu z Schengen.
Podstawowym problemem jest funkcjonowanie jednostek organizacyjnych Służby Celnej przy niepełnych obsadach kadrowych funkcjonariuszy celnych.
W 2009 r. oszacowano, że w 4 izbach celnych obsługujących granicę wschodnią należałoby zwiększyć łączne zatrudnienie o najmniej 560 funkcjonariuszy, to jest o około 11 procent.
[b][link=http://grafik.rp.pl/grafika2/513707]Zobacz raport NIK[/link][/b]