Dziś wchodzi w życie rozporządzenie w sprawie służby medycyny pracy w jednostkach organizacyjnych podległych MON. Określa ono sposób ich tworzenia i organizacji, kwalifikacje pracowników oraz tryb kontroli.
Zgodnie z rozporządzeniem zadania odpowiednie do zadań służby medycyny pracy w zakresie orzecznictwa lekarskiego w stosunku do kandydatów na żołnierzy zawodowych i żołnierzy zawodowych wykonują wojskowe komisje lekarskie. Badaniem żołnierzy mogą się zajmować lekarze specjaliści, którzy w cywilu mogą badać zdolność do pracy na konkretnych stanowiskach. Zadania służby medycyny pracy mogą realizować także lekarze, którzy pełnili służbę lub byli zatrudnieni w pełnym wymiarze czasu przez co najmniej trzy lata jako lekarze w jednostkach organizacyjnych wyłącznie w stosunku do żołnierzy i pracowników tych jednostek.
Badania profilaktyczne żołnierzy narażonych na działanie promieniowania jonizującego i wykonujących pracę w warunkach tropikalnych, morskich mogą przeprowadzać lekarze po odbyciu dodatkowego szkolenia w wojskowych instytutach (np. Wojskowy Instytut Medycyny Lotniczej, Wojskowy Instytut Higieny i Epidemiologii).
Kontrolę badań profilaktycznych prowadzonych przez jednostki podległe MON wykonują poradnie medycyny pracy publicznych ZOZ, będących wiodącymi zakładami wojskowej służby zdrowia. Osoby dokonujące kontroli mają prawo żądać niezbędnych informacji i dostępu do dokumentacji medycznej oraz do stanowisk pracy.