Rozliczanie VAT podatników, u których oprócz czynności opodatkowanych występują też te zwolnione czy nawet zupełnie wyłączone z opodatkowania, nie jest sprawą prostą. Ustawodawca wprowadził ograniczenia, a dokonany przez podatnika wybór odpowiedniego kryterium do wyliczenia współczynnika odliczenia nie zawsze podoba się fiskusowi. Potwierdza to sprawa spółdzielni mieszkaniowej, która we wtorek przegrała przed Naczelnym Sądem Administracyjnym spór ze skarbówką o zakres odliczenia VAT związanego z termomodernizacją.
Czytaj także: Spółdzielnia odliczy VAT od remontu budynku strukturą jego powierzchni
Żmudne wyliczenia
Sprawa dotyczyła spółdzielni z Lidzbarka Warmińskiego. We wniosku o interpretację wyjaśniła ona, że jest zarejestrowanym czynnym podatnikiem VAT. W należącym do niej budynku usługowo-mieszkalnym wykonywane są czynności opodatkowane, tj. wynajmowane są lokale użytkowe stanowiące 64,33 proc. ogólnej powierzchni. Pozostałą – 35,67 proc. – zajmują lokale mieszkalne.
Spółdzielnia tłumaczyła, że zamierza ubiegać się o dofinansowanie wydatków związanych z termomodernizacją tego budynku z urzędu marszałkowskiego. W związku z tym jest obowiązana wskazać wysokość wydatków podlegających dofinansowaniu oraz koszty kwalifikowane, tj. zwolnione od podatku. Jej podatkowe wątpliwości dotyczyły zaś sposobu wyliczenia odliczenia podatku naliczonego: czy ma częściowe prawo do odliczenia VAT? Sama uważała, że ma prawo do częściowego odzyskania VAT w wymiarze 64,33 proc., tj. w zakresie odpowiadającym procentowi powierzchni, na której wykonywana jest działalność podlegająca opodatkowaniu.
Fiskus zgodził się, że podatniczka może częściowo odliczyć VAT. Przypomniał jednak, że gdy niemożliwe jest jednoznaczne rozróżnienie konkretnych wydatków związanych ze sprzedażą opodatkowaną i zwolnioną, odliczenia jest proporcjonalne – stosownie do art. 90 ustawy o VAT. Wtedy jedynym dopuszczalnym kryterium ustalania proporcji jest udział rocznego obrotu z tytułu czynności dających odliczenie w całkowitym obrocie (art. 90 ust. 3 ustawy). Dlatego spółdzielnia nie może stosować kryterium udziału powierzchniowego.