W programie Kinomuzeum znajdą się zarówno zjawiska słabo reprezentowane w kinematografii głównego nurtu, jak i pokazy filmów fabularnych, które miały swoje premiery na znanych festiwalach filmowych. Kinomuzeum rozpocznie swoją działalność 3 lutego, premierowym pokazem "Wstydu" Steve'a McQueena. Film był prezentowany na ostatnim Międzynarodowym Festiwalu Filmowego w Wenecji.
W ofercie filmowych nowości znajdą się również najnowsze dzieła takich twórców jak Miranda July ("Przyszłość"), Jan Švankmajer ("Przeżyć swoje życie"), Wilhelm Sasnal ("Z daleka widok jest piękny"), Wojciech Smarzowski ("Róża"), Phil Mulloy ("Goodbye Mister Christie") oraz odrestaurowany w wersji HD legendarny film Jerzego Skolimowskiego ("Na samym dnie").
W programie Kinomuzeum są również specjalne pokazy w następujących kategoriach: Artist Moving Image, Kolekcja, Re:Forma, Art Documents, Curating Cinema oraz Animacja.
Z okazji uruchomienia Kinomuzeum w hallu wejściowym Muzeum zawiśnie neon legendarnego warszawskiego kina Skarpa, rozebranego pod budowę apartamentowca w 2008 roku.
W pierwszy weekend lutego w siedzibie Muzeum zostanie również otwarta kawiarnia "Moderna", prowadzić ja będą twórcy Warszawy Powiśle.