Informację o jego śmierci przekazał prezydent Ełku. "Ze smutkiem i żalem pragnę poinformować, że nagle zmarł ś.p. Pan Jerzy Czepułkowski - wyjątkowy ełczanin, szlachetny, mądry i dobry człowiek. Dla mnie ktoś bliski i szczególny" – napisał Tomasz Andrukiewicz, prezydent Ełku.
Przyczyna śmierci nie została podana do wiadomości publicznej. Jerzy Czepułkowski był związany z Ełkiem i Mazurami.
Zanim został politykiem i samorządowcem, pracował jako nauczyciel, wicedyrektor i dyrektor Zespołu Szkół Budowlanych w Ełku, oraz pedagog i dyrektor Medycznego Studium Zawodowego w tym mieście.
Od 1994 roku zajął się pracą samorządową i do 1997 roku pełnił funkcję wiceprezydenta Ełku. - Od samego początku niezwykle zaangażował się w budowanie ełckiej samorządności – podał Urząd Miasta w Ełku
W 1997 uzyskał mandat poselski z listy SLD. Po raz drugi został wybrany w wyborach w 2001 z ramienia tego samego ugrupowania w okręgu olsztyńskim. W IV kadencji Sejmu był przewodniczącym Komisji Europejskiej i zastępcą przewodniczącego sejmowej komisji śledczej ds. prywatyzacji PZU.