Nadal nie wiadomo precyzyjnie, jakie zmiany w organizmie wywołuje SARS-CoV-2, ale nie ma wątpliwości, że patogen atakuje układ nerwowy, w tym mózg. Coraz częściej mówi się o neuroinwazji koronawirusa, a problem ten może dotyczyć od 62 do 70 proc. pacjentów. Z dotychczasowych obserwacji wynika, że najwięcej osób skarży się właśnie na zaburzenia w układzie nerwowym.
Zaburzenia poznawcze, czyli problemy z pamięcią, koncentracją, postrzeganiem, mgła mózgowa czy zaburzenia płynności i szybkości przypominania sobie słów to przykłady problemów, których często doznają osoby po przejściu COVID-19. Zdarzają się też konsekwencje psychologiczne, z depresją, stanami lękowymi i bezsennością włącznie.