W miejsce czterech organów dowodzenia poszczególnymi rodzajami sił zbrojnych – Wojsk Lądowych, Sił Powietrznych, Marynarki Wojennej, Wojsk Specjalnych – powstaną dwa ośrodki. Dowództwo Generalne będzie odpowiedzialne za ogólne dowodzenie wojskami w czasie pokoju, natomiast na Dowództwie Operacyjnym będzie spoczywał ten obowiązek w czasie wojen, kryzysów, a także w stosunku do wojsk wydzielonych do udziału w zagranicznych misjach pokojowych.
Posłowie PiS zapowiedzieli zaskarżenie nowelizacji do Trybunału Konstytucyjnego. W ich ocenie sprzeczna z ustawą zasadniczą jest m.in. likwidacja stanowisk dowódców poszczególnych rodzajów wojsk.
