Po wypełnieniu zeznania rocznego może się okazać, że podatnik ma nadpłatę. Oznacza to, że w ciągu roku na konto urzędu skarbowego trafiły za duże zaliczki na podatek. Powody mogą być różne: pomyłka w obliczaniu zaliczek przez płatnika, skorzystanie przez podatnika z odliczeń podatkowych czy preferencyjny sposób rozliczenia. Za nadpłatę – zgodnie z definicją ustawową – uważa się przede wszystkim kwoty nadpłaconego lub nienależnie zapłaconego podatku oraz podatku pobranego przez płatnika nienależnie lub w wysokości większej od należnej.

14 proc. w stosunku rocznym wynosi oprocentowanie nadpłaty zwróconej po terminie

Co do zasady nadpłata powstaje z chwilą uiszczenia nienależnej kwoty. Jednak w przypadku podatników PIT nadpłata powstaje z dniem złożenia zeznania rocznego. W praktyce oznacza to, że podatnik, od którego pensji płatnik pobierał i odprowadzał za duże zaliczki na podatek w ciągu roku, nie może oczekiwać potwierdzenia powstania nadpłaty od chwili popełnienia błędu. Co więcej, w przypadku nadpłat wynikających z PIT rocznego fiskus ma aż trzy miesiące na jej zwrot. Termin ten liczy się od dnia złożenia zeznania rocznego. Oczywiście urząd skarbowy może oddać nadpłatę wcześniej. Jeśli jednak odda ją nawet ostatniego dnia upływu trzymiesięcznego terminu, nie będzie musiał płacić odsetek. Oprocentowanie należne od fiskusa zostanie naliczone jedynie po przekroczeniu terminu. W takim przypadku odsetki zostaną naliczone od dnia powstania nadpłaty, czyli od samego momentu złożenia PIT.

Trzeba też pamiętać, że podatnik, który ma zaległości podatkowe, nie otrzyma zwrotu nadpłaty do „ręki". W pierwszej kolejności nadpłaty wraz z ich oprocentowaniem podlegają zaliczeniu z urzędu na poczet zaległości podatkowych wraz z odsetkami za zwłokę oraz bieżących zobowiązań podatkowych. Jeżeli podatnik nie ma zaległości i nie złożył dobrowolnie wniosku o rozliczenie nadpłaty na poczet przyszłych należności podatkowych, nadpłacone pieniądze dostanie w gotówce na wskazany rachunek bankowy lub przez pocztę albo w kasie organu. Najkorzystniejszy jest zwrot na konto bankowe (przy przekazie potrącone są koszty).