Hel, który jest niezwykle rzadkim gazem, który trudno znaleźć, wydobyć oraz przechowywać, jest wykorzystywany przede wszystkim w medycynie, na przykład podczas rezonansu magnetycznego, może być używany do wentylacji mechanicznej pacjentów z ciężką obturacją oskrzeli oraz jako gaz napędowy w balonach do kontrapulsacji wewnątrzaortalnej, zabiegu stosowanego przy niewydolności krążeniowej.
Jest także wykorzystywany w nauce - na przykład w Wielkim Zderzaczu Hadronów, do wypełniania statków powietrznych lżejszych od powietrza, czyli balonów i sterowców, a także do chłodzenia tam, gdzie potrzebne są ekstremalnie niskie temperatury, m.in. do chłodzenia nadprzewodników. Jest też składnikiem mieszanki do oddychania dla nurków.