Kwestią szczególnie kontrowersyjną jest sposób traktowania przez przepisy ustawy lokalnych jednostek samorządu terytorialnego. Literalna interpretacja przepisów wskazywałaby, że podatnikami podatku od nieruchomości są gminy, powiaty, województwa oraz Skarb Państwa, jeżeli obowiązek podatkowy nie ciąży na posiadaczu zależnym.
Takie stanowisko prezentuje m.in. Ministerstwo Finansów, które w odpowiedzi na interpelację poselską (odpowiedź podsekretarza stanu w Ministerstwie Finansów na interpelację nr 667 w sprawie opodatkowania podatkiem od nieruchomości mienia gminnego z 13 stycznia 2012 r.) stwierdziło, że możliwa jest sytuacja, aby gminny organ podatkowy występujący jako podmiot prawa publicznego pobierał podatek od gminy jako podmiotu cywilnoprawnego (właściciela nieruchomości).
Niemniej jednak uznanie, że gmina jest podatnikiem podatku od nieruchomości względem samej siebie, jest poglądem wysoce dyskusyjnym. Naszym zdaniem nie do pogodzenia z porządkiem prawnym byłoby przyjęcie poglądu, że właściciel, jakim jest gmina, podlega obowiązkowi podatkowemu w zakresie podatku, którego jest beneficjentem.
W konsekwencji, w naszej ocenie, gmina nie jest podatnikiem podatku od nieruchomości względem samej siebie. Jednak może być podatnikiem względem innej gminy. Podatnikami podatku od nieruchomości są zaś powiaty, województwa i Skarb Państwa (w imieniu którego działa starosta).
