Jest ona wynikiem nadużywania przez spółkę swojej pozycji dominującej na rynku. W lipcu 2009 roku wraz z karą finansową prezes Urzędu Ochrony Konkurencji i Konsumentów nałożyła na PKP Cargo zakaz dyskryminowania partnerów.
Urząd ustalił wówczas, że spółka świadczyła usługi przewozowe na zasadach ogólnych oraz na zasadach szczególnych związanych z oferowaniem atrakcyjnych upustów cenowych. Przedsiębiorca uznany za konkurenta PKP Cargo w zakresie przewożonych towarów mógł podpisać umowę jedynie na zasadach ogólnych.
Tym samym spółka wykorzystała swoją pozycję rynkową, pozbawiając wybranych przez siebie przedsiębiorców możliwości uczestniczenia w obrocie na korzystniejszych warunkach.
PKP Cargo odwołało się od decyzji. Sąd Apelacyjny jej nie zmienił. W uzasadnieniu wyroku stwierdził m.in., że działania spółki prowadziły do naruszenia konkurencji i uniemożliwiały rozwój rynku przewozów kolejowych.
Zysk PKP Cargo w ubiegłym roku wyniósł 237,7 mln zł i był o 175,8 mln zł wyższy niż ten z roku 2010. Zysk na sprzedaży w ubiegłym roku wyniósł 334,6 mln zł, w roku 2010 – 58,7 mln zł. Przychody wzrosły o 9,7 proc. rok do roku i wyniosły 5,09 mld zł.