W tym Oddziale Muzeum Narodowego zgromadzono wspaniałe skarby, przede wszystkim sztuki średniowiecznej i renesansowej, ale także późniejszych epok. Wnętrza też przykuwają uwagę polichromiami z różnych epok, średniowiecznymi i renesansowymi oknami, autentycznymi belkami stropu, pięknymi detalami architektonicznymi.
W Galerii Sztuki Dawnej Polski. XII-XVIII wiek można zobaczyć trzysta dzieł, wybranych ze znakomitej kolekcji sztuki staropolskiej MNK, liczącej około dwa tysiące obiektów. Są wśród nich prawdziwe perły, jak piękna Madonna z Krużlowej, rzeźba Wita Stwosza Chrystus w Ogrójcu, czy najstarsze polskie epitafium wykonane dla Wierzbięty z Branic, stolnika krakowskiego i starosty sanockiego.
Madonna z Krużlowej jest jednym z najwybitniejszych przykładów tzw. stylu pięknego w gotyku międzynarodowym około roku 1400. Figura Marii z Dzieciątkiem została wycięta w drewnie lipowym i polichromowana. Szaty Madonny ozdabia bogactwo draperii. Twarze matki i syna opromienia delikatny uśmiech. Tchnąca liryzmem kompozycja zdradza rękę mistrza, choć nie znamy jego imienia.
Z kolei galeria Sztuka Cerkiewna Dawnej Rzeczypospolitej - jedna z najstarszych i najcenniejszych w Europie Środkowej kolekcji - obejmuje trzysta wybranych dzieł, pochodzących z południowo-wschodnich terenów przygranicznych dawnej Rzeczypospolitej. Główną częścią zbioru są XV-XVI-wieczne ikony z Karpat, zwane zachodnioruskimi. Aranżacja ekspozycji, dzięki wykorzystaniu ikonostasu z Lipowca na Kijowszczyźnie, upodabnia tę przestrzeń do cerkiewnego wnętrza.
W piwnicach Pałacu znajduje się ekspozycja „Kraków na wyciągnięcie ręki. Rzeźba architektoniczna ze zbiorów MNK". Obejmuje ona osiemset fragmentów najcenniejszych rzeźb z całej Polski, m.in. pochodzących z kościoła Mariackiego, katedry krakowskiej i katedry gnieźnieńskiej. Są to wykonane z kamienia elementy oryginalne lub gipsowe odlewy rzeźb z portali, zworników, nagrobków królewskich.
Pałac został wzniesiony w latach 1501-1503 dla biskupa płockiego Erazma Ciołka, sekretarza króla Aleksandra Jagiellończyka, a także dyplomaty, humanisty i mecenasa sztuki. Architektura budynku przy Kanoniczej 17 nosi cechy gotyckie oraz wczesnorenesansowe. W początkach wieku XVI mieściła się tutaj, obok rezydencji biskupiej, drukarnia Floriana Unglera. Przez dwa ostatnie wieki budynek zmieniał często użytkowników i tak został zdewastowany, że stracił reprezentacyjny charakter i popadł w ruinę. W 1996 roku przekazano go Muzeum Narodowemu. Po kilkuletnim remoncie odzyskał blask i został w 2007 roku udostępniony publiczności. Obecna roczna przerwa była spowodowana względami konserwatorskimi
Z okazji ponownego otwarcia na weekend MNK przygotowało specjalny program, obejmujący zwiedzanie z przewodnikiem, wykłady i koncert. A także prezentację wyjątkowego dzieła: cyborium czyli tabernakulum z katedry na Wawelu. Jego twórcą był renesansowy włoski artysta Jan Maria Padovano. Wykonał je na zlecenie biskupa Piotra Tomickiego, królewskiego powiernika i mecenasa sztuki. Pierwotnie tabernakulum stało w prezbiterium katedry, niedaleko nagrobka Władysława Łokietka. W XVII wieku przeniesiono je do kaplicy Mariackiej, a potem jego elementy uległy rozproszeniu. Teraz cyborium wawelskie po raz pierwszy poddano rekonstrukcji i w Pałacu Erazma Ciołka będzie można zobaczyć część w formie małej kolistej świątyni wraz z adorującymi aniołami.