W stosunku do tradycyjnego podpisu elektroniczny ma wiele zalet. Należą do nich:

– możliwość podpisywania danych w formie komputerowej: plików, poczty elektronicznej, urządzeń informatycznych (np. serwera),

– o wiele większa trudność podrobienia w porównaniu z podpisem odręcznym,

– większa precyzja stosowania,

– łatwiejsza weryfikacja zmian w podpisywanych dokumentach.

Do głównych wad podpisu elektronicznego należy konieczność stosowania sprzętu i infrastruktury informatycznej (komputer, dostęp do Internetu) oraz brak bezpośredniego powiązania z cechami osobowymi osoby podpisującej.