W wyniku kataklizmu powstały podwodne wydmy. Zdaniem naukowców z Uniwersytetu Tohoku w Sendai zmienią one niekorzystnie ekosystem. Badaniami zmian oceanicznego dna po tsunami zajmuje się zespół prof. Kazuhisa Goto. Wiadomość o tym zamieszcza „Marine Geology".
Zatoka Kessennuma, położona 90 km na północ od miasta Sendai, jest osłonięta przed wiatrami i falami z otwartego oceanu, służy statkom za schronienie przed nadciągającymi cyklonami. 20 dni po tsunami zespół prof. Goto badał jej dno. Chodziło o sprawdzenie, czy zatoka wciąż nadaje się jako schronienie dla statków po wtargnięciu do niej tsunami wysokości 20 m.
Tsunami trwale zmieniło ukształtowanie dna w strefie przybrzeżnej. Osady denne zostały przesunięte, utworzyły się z nich podwodne wydmy na głębokości 10–15 m. Wydmy mają 1,8 m wysokości i 20 m długości. Nigdy wcześniej w zatoce nie obserwowano takich obiektów.