Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z 16 grudnia 1985 r. (SA/Lu 572/85, ONSA 1985/2/36) stwierdził, że wydane przez kierownika urzędu polecenie przeprowadzenia przez rzecznika dyscyplinarnego postępowania wyjaśniającego wszczyna tylko postępowanie wyjaśniające, a nie dyscyplinarne. Nie daje zatem podstawy do wydania decyzji o zawieszeniu pracownika w pełnieniu obowiązków służbowych. Z kolei NSA w wyroku z 15 maja 1996 r. (II SA 2841/95, Pr. Pracy 1996/10/46) wyjaśnił, że nie można zawiesić mianowanego urzędnika państwowego w pełnieniu obowiązków służbowych z powodu wszczęcia przeciwko niemu postępowania dyscyplinarnego, jeżeli wniosek o ukaranie karą dyscyplinarną został zwrócony kierownikowi urzędu do uzupełnienia.
Zawieszenie z powodu wszczęcia postępowania dyscyplinarnego nie może trwać dłużej niż trzy miesiące. Tak wprost wynika z ustawy o pracownikach urzędów państwowych. Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z 27 marca 1992 r. (II SA 175/92, PS 1994/5/86) zaznaczył, że decyzja o zawieszeniu w pełnieniu obowiązków służbowych urzędnika państwowego mianowanego musi określać termin tego zawieszenia. Jest to termin materialnoprawny, a nie procesowy, gdyż dotyczy istotnego ograniczenia uprawnień pracowniczych.
Istotne jest również to, że decyzja o zawieszeniu pracownika mianowanego w pełnieniu obowiązków służbowych nie może być podjęta z mocą wsteczną (por. wyrok NSA z 10 stycznia 2001 r., II SA 1554/00, Pr. Pracy 2001/6/39).
Cała albo połowa pensji
Zgodnie z ogólną zasadą wynikającą z art. 80 kodeksu pracy pracownikowi przysługuje wynagrodzenie za pracę wykonaną. Natomiast za czas niewykonywania pracy ma on prawo do wynagrodzenia tylko wówczas, gdy przepisy tak stanowią. Takimi szczególnymi przepisami są art. 11 ust. 2 i art. 12 ust. 3 ustawy o pracownikach urzędów państwowych.
W myśl pierwszego z nich wynagrodzenie w okresie tymczasowego aresztowania urzędnika państwowego ulega ograniczeniu do połowy. Jeżeli zapadł wyrok uniewinniający lub postępowanie karne zostało umorzone, urzędnikowi wypłaca się pozostałą część wynagrodzenia, chyba że postępowanie karne umorzono warunkowo lub na podstawie amnestii, a zainteresowany w przepisanym trybie nie domagał się rehabilitacji.
Natomiast w przypadku zawieszenia w pełnieniu obowiązków służbowych z powodu wszczęcia postępowania dyscyplinarnego urzędnik państwowy mianowany ma zagwarantowane wynagrodzenie i inne świadczenia przysługujące na podstawie stosunku pracy. Uprawnienia płacowe z tego tytułu są jednak ustawowo ograniczone do trzymiesięcznego okresu zawieszenia w pełnieniu czynności służbowych (por. wyrok Sądu Najwyższego z 8 kwietnia 1998 r. I PKN 31/98, OSNP 1999/7/244).