Do najważniejszych zadań, które będą realizowane ze środków Funduszu należą:

- ochrona i zrównoważone gospodarowanie zasobami wodnymi;

- racjonalne gospodarowanie odpadami i ochrona powierzchni ziemi;

- ochrona atmosfery;

- ochrona różnorodności biologicznej i funkcji ekosystemów.

Natomiast wśród najważniejszych działów jakie znalazły się w planach realizacyjnych Funduszu są: edukacja, ekspertyzy, innowacyjność, niskoemisyjna i zasobooszczedna gospodarka, monitoring środowiska, zapobieganie zagrożeniom, wspieranie zarządzania środowiskiem.

To właśnie na tego rodzaju działania beneficjenci NFOŚiGW będą mogli pozyskiwać w najbliższych latach finansowe środki w różnych formach np. kredytach czy dotacjach albo wsparciu konkretnego przedsięwzięcia nawet do 100 procent kwalifikowanej wielkości projektu.

Część przedsięwzięć Fundusz będzie finansował nawet w wysokości do miliona euro.