Marek Frąckowiak był absolwentem Wydziału Aktorskiego łódzkiej PWSFTviT.

Zadebiutował w 1971 roku w nagrodzonym na festiwalu w San Sebastian filmie Jerzego Passendorfera "Zabijcie czarną owcę".

Miał na koncie ponad sto ról filmowych i teatralnych, zagrał m.in. w filach Niespotykanie spokojny człowiek, Anatomia miłości, Pójdziesz ponad sadem, Alternatywy 4, Azyl, C.K. Dezerterzy, Przyłbice i kaptury, Polskie drogi, 07 zgłoś się, Dom, Żegnaj Rockefellerze, Psy, Młode Wilki, Ogniem i mieczem, Kryminalni, Pitbull, Ekipa, Teraz albo nigdy!, Ranczo, Popiełuszko.

Był założycielem i prezesem Fundacji Przyjaciół Sztuk Aurea Porta , zajmującej się m.in promocją twórczości muzycznej, dramaturgicznej i graficznej Bogusława Schaeffera.

Prywatnie Marek Frąckowiak był mężem aktorki Ewy Złotowskiej.