Do Naczelnej Izby Aptekarskiej napływało wiele zapytań od farmaceutów o to czy można łączyć funkcje kierownika apteki ogólnodostępnej z kierownikiem działu farmacji szpitalnej. Zdaniem samorządu aptekarskiego można być kierownikiem tylko jednej apteki. Tak stanowi art. 88 ustawy prawo farmaceutyczne.
Jednocześnie aptekarze wskazują, że przepisy nie regulują jasno kwestii równoczesnego sprawowania funkcji kierownika apteki i kierownika działu farmacji szpitalnej. Jest mowa tylko ogólnie o aptekach.
Zdaniem samorządu aptekarskiego, pomimo braku literalnego przepisu, zakazującego łączenia funkcji kierownika apteki i kierownika działu farmacji szpitalnej zakaz taki można zinterpretować z celu, jaki ma spełnić przepis art. 88. Zakaz taki można też wywieść z innych przepisów dotyczących wykształcenia farmaceutów.
Dział farmacji spełnia w szpitalu takie same funkcje jak apteka. Dział tworzy się w szpitalach, w których nie ma apteki. Dlatego samorząd aptekarski tłumaczy, że ich funkcje są tożsame
„Do czynności znajdujących się w zakresie zadań działu farmacji szpitalnej, obok wydawania produktów leczniczych, znajduje się również udzielanie informacji o produktach, organizowanie zaopatrzenia w produkty lecznicze oraz wyroby medyczne, udział w monitorowaniu działań niepożądanych, udział w racjonalizacji farmakoterapii czy współuczestniczenie w prowadzeniu gospodarki produktami leczniczymi i wyrobami medycznymi w szpitalu. Do bardzo istotnego zadania przypisanego działowi farmacji szpitalnej należy również prowadzenie ewidencji badanych produktów leczniczych oraz produktów leczniczych i wyrobów medycznych otrzymywanych w formie darowizny. Tak szeroki zakres czynności przypisanych działowi farmacji szpitalnej, miejsce oraz fakt, że wszystkie te czynności łączą się z udzielaniem usług farmaceutycznych oraz jednoznaczne przesądzenie wprost w ustawie, że dział farmacji szpitalnej pełni funkcję apteki szpitalnej wywołuje określone skutki w zakresie dotyczącym wymogu wynikającego z art. 88 w „
